迟到，属于缺勤 ， 只是缺勤的时间较短 ， 迟到的时间没有劳动，不发给报酬符合法律规定 。无正当理由迟到，因为迟到导致用人单位经济损失的，劳动者还应当赔偿损失 。
对迟到工资的具体扣发，法律没有明确规定，可由用人单位依法制定的规章制度规定 。
对于公司规定迟到一分钟5块钱是否合法的问题，如果该公司的规章制度中 ， 有迟到罚款这样的规定，且该公司的规章制度是经过民主程序制度 ， 即制定颁布程序是合法，只要罚款的数额不超过法律规定的必要限度，就是合法的 。
法律依据：
《中华人民共和国劳动法》第九十一条用人单位有下列侵害劳动者合法权益情形之一的，由劳动行政部门责令支付劳动者的工资报酬、经济补偿，并可以责令支付赔偿金：
?。ㄒ唬┛丝刍蛘呶薰释锨防投吖ぷ实模?
?。ǘ┚懿恢Ц独投哐映すぷ魇奔涔ぷ时ǔ甑模?
?。ㄈ┑陀诘钡刈畹凸ぷ时曜贾Ц独投吖ぷ实模?
【公司规定迟到一分钟5块钱合法吗】 ?。ㄋ模┙獬投贤螅?未依照本法规定给予劳动者经济补偿的 。
