合法小产权房转让合同有效 。合法的小产权房是指拥有宅基地使用权证，取得规划许可、施工许可证，并办理了房屋产权证的村民自住房 。如果小产权房未取得前述相应的材料的，转让合同无效 。
法律依据：
《中华人民共和国土地管理法》第十二条
土地的所有权和使用权的登记 ， 依照有关不动产登记的法律、行政法规执行 。
依法登记的土地的所有权和使用权受法律保护，任何单位和个人不得侵犯 。
第八十二条
【小产权房转让合同有效吗】擅自将农民集体所有的土地通过出让、转让使用权或者出租等方式用于非农业建设，或者违反本法规定 ， 将集体经营性建设用地通过出让、出租等方式交由单位或者个人使用的，由县级以上人民政府自然资源主管部门责令限期改正，没收违法所得，并处罚款 。
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