公诉案件如果已经立案，除发现不应对犯罪嫌疑人追究刑事责任的情形外，是不可以撤案的 。
【法律依据】
【如果批捕了赔偿对方可撤案吗】根据《刑事诉讼法》第一百六十三条，在侦查过程中，发现不应对犯罪嫌疑人追究刑事责任的 ， 应当撤销案件;犯罪嫌疑人已被逮捕的 ， 应当立即释放，发给释放证明，并且通知原批准逮捕的人民检察院 。
根据《中华人民共和国刑事诉讼法》第十六条，有下列情形之一的，不追究刑事责任，已经追究的 ， 应当撤销案件，或者不起诉，或者终止审理 ， 或者宣告无罪：
(一)情节显著轻微、危害不大，不认为是犯罪的;
(二)犯罪已过追诉时效期限的;
(三)经特赦令免除刑罚的;
(四)依照刑法告诉才处理的犯罪 ， 没有告诉或者撤回告诉的;
(五)犯罪嫌疑人、被告人死亡的;
(六)其他法律规定免予追究刑事责任的 。
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