有益的微生物有哪些?有益的微生物用途包括生物药品、生物农药；生物肥料；毒素；及净化环境的微生物制剂等 。
用于人体及动物的叫益生菌，是指能够在人或动物体内存活，对宿主的生命健康有益的一类微生物，它是人或动物胃肠道共生微生物 。主要有蜡样芽孢杆菌、枯草芽孢杆菌、乳酸杆菌、乳酸球菌、粪链球菌、双歧杆菌等 。
【有益的微生物有哪些?】用于水质处理的有益微生物有：
1.硝化作用的微生物：亚硝酸细菌：亚硝酸单胞菌、亚硝酸球菌、亚硝酸螺旋菌、亚硝酸叶状菌、亚硝酸弧菌 。硝酸细菌：硝酸杆菌、硝酸针状菌、硝酸球菌 。
1.反硝化作用的微生物：假单胞菌、产碱杆菌、芽孢杆菌、硫杆菌属、脱氮硫杆菌、红假单胞菌、副球菌属、布兰汉氏菌属，奈氏球菌属 。
3.硫化作用的微生物：硫化细菌、丝状硫细菌和光能自养硫细菌 。
4.反硫化作用的微生物：脱硫弧菌 。
用于生物肥料有益微生物有：根瘤菌、圆褐固氮菌、巨大芽胞杆菌、胶质芽胞杆菌（硅酸盐细菌） 。
用于生物农药的有益微生物产生抗菌物质，抑制或杀死病原菌，这称为抗菌作用 。例如，绿色木霉产生胶霉毒素和绿色菌素两种抗菌素，拮抗立枯丝核菌等多种病原菌 。哈茨木霉和钩木霉可以寄生立枯丝核菌和齐整小核菌菌丝，豌豆和萝卜种于用木霉拌种可防治苗期立枯病与猝倒病 。
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