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3、应用方式不同
消毒，有物理方法，化学方法及生物方法，但生物方法利用生物因子去除病原体，作用缓慢，而且灭菌不彻底，一般不用于传染疫源地消毒，故消毒主要应用物理及化学方法 。
灭菌常用的方法有化学试剂灭菌、射线灭菌、干热灭菌、湿热灭菌和过滤除菌等 。可根据不同的需求，采用不同的方法，如培养基灭菌一般采用湿热灭菌，空气则采用过滤除菌 。
消毒和杀菌有什么区别呢一、处理水平不同
消毒：消毒只要求杀灭或清除致病微生物，使其数量减少到不再能引起人发病 。
杀菌：灭菌不仅要求杀灭或清除致病微生物，还要求将所有微生物全部杀灭或/和清除掉，包括非致病微生物 。
二、方法不同
消毒：消毒的处理方法包括紫外线消毒、臭氧消毒、含氯消毒剂、巴氏消毒法等 。
杀菌：杀菌的处理方法包括物理法和化学法，其中物理法包括热力、辐射、微波、等离子体、干热灭菌和高压蒸汽灭菌等，化学法包括醛类、烷化剂等 。
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三、应用不同
消毒：消毒用于处理日常生活和工作场所的物品，也用于医院中一般场所与物品的处理 。
杀菌：灭菌主要用于处理医院中进入人体无菌组织器官的诊疗用品和需要灭菌的工业产品 。
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