白芷含淀粉量较高，很不易干燥 。收获后或加工过程中如遇阴雨天气，鲜根或晒软的根都可用硫磺熏蒸，防止霉烂 。熏时将白芷置密闭的室或箱的架子上，点燃架下盛器中的硫磺 。每100kg白芷用硫磺500g 。熏1-3天后再晒干或烘干（硫磺要熏透：硫磺慢慢加人，使不熄火断烟，常取样检查，把根切开涂上碘酒，若蓝色很快消失，表示已熏透，否则须继续熏 。） 。烘干用炕，温度以60℃左右为宜 。无论晒干或烘干，干燥过程均要连续进行，中间不可中断，否则尽管最后完全干燥，但其根心部会变黑而质量下降 。每3-4kg鲜根可加工出lkg干药材 。白芷成品以根条肥大、均匀、质重、粉性足、香气浓者为佳 。
白芷病虫防治病害斑枯病：又名白斑病，是真菌中一种半知菌，常在生长后期发生，主要为害叶片，病斑为多角形，初期暗绿色百思特网，后变为灰白，上面生有黑色小点 。可使叶片全部枯死 。防治方法：及时清除病叶并集中烧毁；发病前或初期用l：1:100的波尔多液或65%代森锌可湿性粉剂400-500倍液喷雾，7-10天1次，连续2-3次 。[13]虫害 有黄凤蝶幼虫、红蜘蛛及蚜虫等，可用杀虫剂杀灭 。
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